大多數飼料加熱處理后，可以使蛋白質結構發生劇烈的變化，尤其蛋白質中賴氨酸、精氨酸、組氨酸、亮氨酸和苯丙氨酸遭到破壞，因而飼料蛋白質的利用率和生物學價值也發生了變化。一般常用的飼料，如禾本科谷類籽實(如玉米、大麥、麩皮、米糠等)、油餅類(豆餅、花生餅等)、動物性飼料(如骨肉粉、魚粉、血粉等)、酒糟、啤酒糟等，一經加熱處理，它們的蛋白質就發生變性，從而蛋白質的生物學價值降低。

但是，并非對所有飼料都是如此。如對大豆(黃豆、黑豆)或大豆粉進行適當加熱處理，則可提高蛋白質的生物學價值。因為大豆中含有一種胰蛋白酶的抑制劑，會制止大豆蛋白質在畜體內的消化和利用。在家畜日糧中如果存有這種胰蛋白酶的抑制劑，不僅會降低大豆本身蛋白質的消化和利用，而且還會降低整個日糧蛋白質的消化和利用。而適當加熱處理，可以使胰蛋白酶的抑制劑受到破壞，從而提高大豆蛋白質的生物學價值。例如，生大豆的蛋白質的生物學價值為57%，經過加熱處理后，則提高到64%。又如，某些豆科作物的蛋白質，尤其是豌豆，經過煎煮處理后，其蛋白質的消化和利用均比較好，氮的利用可提高20%，豬的增重提高25%。由此可見，有些飼料，如豆科籽實及馬鈴薯等，經過適當加熱處理(時間不宜過長，否則，反使蛋白質變性)，可以提高蛋白質的生物學價值。

因此，在家畜的飼養過程中，飼料是進行生喂還是熟喂，要根據飼料的性質及其分子結構而定，不能搞一刀切和絕對化，適合生喂的飼料，一定要生喂。不能生喂的飼料，一定要煮熟或炒熟后再喂。