無籽西瓜具有生長勢強、抗病、含糖量高的特點，但也存在采種量低、發芽率低、成苗率低的“三低”問題。為此各地都在探索解決途徑。綜合各地生產及試驗結果，可以采用以下有效措施克服“三低”。 

    1、人工輔助授粉。無籽西瓜制種時，利用父本普通西瓜的混合花粉(同一品種不同株的花粉)，對母本四倍體進行人工授粉，使更多、更理想的花粉落到柱頭上，增加花粉的發芽率，促進花粉管迅速生長，順利完成受精作用，從而提高種子質量。 

    2、增施磷肥。據中國農科院果樹研究所研究，增施磷肥平均單瓜產籽量比未施磷區提高12.2-25%。施磷不但能提高母本四倍體西瓜的產籽量，而且對提高四倍體種子孕性，促進種胚發育，提高無籽西瓜種子的千粒重、發芽率和成苗率都有顯著作用。 

    3、適量施硼。據研究，施硼對提高無籽西瓜種子孕性，增加其采種量有較好的效果。育苗時每公斤營養土加硼砂2毫克，孕蕾至開花期間隔7天噴0.05%的硼液2次，畝產籽量比對照高53.4%。 

    4、合理密植。密植是提高種子產量的重要途徑。一般以每畝種植1000-1400株，每株留1個瓜為宜。 

    5、破殼高溫催芽。人工破殼是提高無籽西瓜發芽率簡便、有效的措施，一般是先浸種，后破殼。催芽時溫度應保持在35℃-37℃。

    6、改善栽培條件。播前一定要浸種催芽，采用營養缽育苗，育苗苗床內溫度要高于普通西瓜。無籽西瓜幼芽的頂土能力較差，播種時土質要松，播種要淺，蓋土0.5厘米為宜，人工剝除“帶帽”。