多數菜農施用農藥是憑自己多年的經驗，而不是根據病蟲害的發生和發展規律。對于各種瓜菜病害，不論是真菌性病害、細菌性病害、病毒性病害還是生理性病害，看見蔬菜葉、果稍有變化就噴施農藥；對于各種瓜菜蟲害，不管是由螨類還是蚜蟲引起的，也不管所用之藥能不能兼治其蟲,只要見蟲就打。其實，每種病蟲各有獨特的習性與危害特點，如白粉病易侵害瓜菜幼嫩部分，黑斑病則易從下部葉片開始浸染，螨類多集結于瓜菜葉背部，吸取蔬菜汁液。大部分防治病蟲害的藥劑，專一性特別強，往往針對某一種或某一類病原物引起的病害，對其他病害則無效。所以在施用上一定要因病、因蟲施藥。

個別菜農見到棚室內有蟲害，就會馬上噴施農藥來徹底消滅掉，其實完全沒有必要。從經濟學角度來講，棚室內的害蟲只要不超過防治指標就不應該防治，否則有可能會降低產出投入比的。