水稻細菌性基腐病病原為歐氏桿菌屬細菌，主要通過水稻根部和莖基部的傷口侵入。該病主要危害水稻根節部和莖基部，使之變褐，逐漸發黑腐爛，病株易被拔起，有惡臭味。一般在水稻分蘗期開始發生，病株莖基部的葉鞘上產生水漬狀病斑，逐漸向上擴展，形成邊緣深褐色、中間枯白色的不規則大病斑，莖基部變灰黑色，有時節間出現黑褐色縱條斑，心葉青枯卷曲，最后枯黃，似螟蟲危害造成的枯心苗。后期病株莖基部和根部變黑并逐漸腐爛，地上部逐漸枯死。有時病株基部莖節上長出倒生根。該病的獨特癥狀是病株根節部變為褐色或深褐色腐爛，有別于細菌性褐條病心腐型、白葉枯病急性凋萎型及螟害枯心苗等。該病常與小球菌核病、惡苗病、還原性物質中毒等同時發生，或在病株枯死后，惡苗病病菌、小球菌核病病菌等腐生其上。

       水稻細菌性基腐病一般有3個發病高峰，分蘗期出現第一發病高峰，以“枯心型”病株為主；孕穗期出現第二發病高峰，以“剝死型”病株為主；抽穗灌漿期出現第三發病高峰，以“青枯型”病株為主，以后出現枯孕穗、枯白穗等癥狀。偏施或遲施氮肥，稻株柔嫩，發病重。分蘗末期不脫水或烤田過度易發病。地勢低，黏重土壤通氣性差，發病重。移栽稻因移栽時植傷重，傷口多，一般比直播稻發病重。

       葉枯唑主要用于防治植物細菌性病害，內吸性強，具有預防和治療作用，持效期長，藥效穩定，對作物無藥害。防治水稻細菌性基腐病，在發病初期可以用葉枯唑、農用硫酸鏈霉素、堿式硫酸銅、氫氧化銅、噻森銅、噻菌銅、琥膠肥酸銅、絡氨銅、噻唑鋅、辛菌胺醋酸鹽、中生菌素等藥灌根或噴霧，有一定的防治效果。注意銅制劑應避開高溫時段施藥。水稻細菌性基腐病在發病后用藥防治效果較差。發病前選用上述藥，在水稻移栽前、分蘗期、抽穗前期分別防治一次，防病效果較好。此外，防治水稻細菌性基腐病還應重點采取農業措施預防，選用發病輕的品種；培育壯秧，減少移栽時的損傷；合理施肥，增施鉀肥；避免烤田過度和長期深水灌溉。