利用草甘膦防治菟絲子的原理，主要是利用寄生與寄主兩種植物對草甘膦耐藥性的不同，即大豆對草甘膦有較強的耐藥性，能忍受一定計量范圍的藥液濃度，而菟絲子的耐藥能力卻很差。方法是：在菟絲子出苗后不久，危害大豆的初期，發現有菟絲子發病中心時，用10%草甘膦400倍稀釋液噴灑在發病中心的大豆植株上，噴藥要均勻，不要漏噴。噴藥后10-15天，菟絲子大量死亡。但藥后3-4天時，大豆的幼葉開始黃化，即有輕微藥害表現，但對其生長發育沒有大的影響，約7天后黃化株率停止擴展，10天左右幼葉全部變綠，恢復正常生長。