留種：一是選無病地塊留種，防止薯塊帶病入窖，從采苗圃剪蔓的夏薯留種很少帶病，不能用春薯和炕苗、溫床苗栽的夏薯留種，受水淹的地塊也不宜留種。二是適時收刨，防止窖外凍害。如果在田間受凍害，在貯藏前（入窖20天左右）就會腐爛。收刨種薯最好在10月中旬開始，霜降前收完。選晴暖天氣上午收刨，當天下午入窖，這樣經過中午晾曬，能減輕破皮。如不能當天入窖，必須注意覆蓋防凍。若留種田遭受霜凍，要剔除露出地面受凍的薯塊。三是實行“四輕”，防止破皮。傷口是病菌侵染的門戶，為防破傷，收刨時要做到輕刨、輕裝、輕運、輕放，嚴格剔除破傷薯塊，直接入窖堆放。四是留足單放，防止侵染。留種數量，一般每栽一畝春薯要留種60公斤。單窖單放或單堆單放，不可與食用甘薯混放，不同品種也要分別存放。

    種薯安全貯藏：一是因地制宜選擇貯藏窖。常用的有井窖、棚窖、崖頭窖和永久大窖，只要將窖管理好，都能安全貯藏。二是做好入窖工作。入窖前，舊窖要清掃消毒，井窖、崖頭窖要刮去一層田土，也可用硫磺點燃后蓋嚴窖口、氣眼熏蒸消毒（1立方米用硫磺100克），入窖時輕拿輕放堆放整齊，貯量一般占薯窖空間2/3為宜。三是保證貯藏的適宜溫度。一般入窖初期溫度可能高些，應開窖口和氣眼，散熱排濕，待窖溫基本穩定在14℃—15℃時適時關閉窖口、氣眼，防窖溫急劇下降。在貯藏中期，為保證窖溫不低于10℃，除關窖門及氣眼外，還可加厚窖頂蓋土或垛草，薯堆上也可蓋草，薯堆外垛草墻、窖旁設置擋風障等。貯藏后期天氣轉暖，也要注意寒流。四是防止貯藏期濕窖。窖內濕度過大，若保暖不好，常會產生凝結的氣流水附在薯塊表面，引起爛窖。防止方法是在薯堆上蓋一層草或草苫吸水汽，草濕了可再換干的。五是適當通風，防止悶窖腐爛。這種現象多發生在深井窖，在封窖早、裝得滿、窖溫高、薯塊破傷多的情況下發生。要注意在晴暖天氣適當打開窖口通風，防止悶窖腐爛。