指測計酵母、細菌等的細胞數。有總菌計數和活菌計數兩種計數法。后者是測計試樣中的活細菌數。二者都是先把試樣稀釋成適于測計的濃度，再用種種方法進行細胞數的測計。一般認為用細胞計數器測計更為精確。有的方法是把細胞用血球容量計進行離心沉淀，從其刻度的容積進行換算；還有一種方法是比濁法。在測計固氮細菌時，可用凱氏定氮法測定有機氮（或是蛋白態氮），然后換算成細菌數。進行活菌計數時，先把樣品稀釋，然后將一定量稀釋樣品混入依菌性質制成的溶融狀態的瓊脂培養基中進行平面培養，再根據菌落數進行統計。對已鑒別過的菌種或具有某種特定性質的細菌來說，活菌計數比較簡單，但對土壤微生物區系量的分析就比較復雜了。
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