修飾基因 modifier， modifying gene 對主基因的作用有各種各樣修飾作用的基因稱為修飾基因。單獨的修飾基因表面上并不顯有作用。在哺乳動物中盡管存在決定毛色呈黑色的主基因．但已知有多種灰色、褐色或黃色等使顏色淡化的隱性修飾基因群存在的例子（W．E．Castle．1954）。這些修飾基因似乎能使色素量減少．當主基因決定白化時．不論什么修飾基因都不顯示作用。已知還存在著抑制性地干擾主基因作用的修飾基因．例如雞中存在著能抑制色素形成的顯性修飾基因（F．B．Hutt．1949），這些修飾基因對主要基因是上位關系。