鼠疫為多途經傳染，靠莢膜，多種毒性抗原，內毒素及毒性酶，透明質酸酶，溶纖維蛋白酶等致病。

鼠間的鼠疫一般在人間發生流行之前發生。通過鼠蚤吸血傳播。

人被感染的鼠蚤叮咬而傳染。也可因宰殺感染后的動物，由破損創口侵入，或因吸入含本菌的氣溶膠感染。臨床常見的病型有：

（1）腺鼠疫 主要由野鼠傳染家鼠，再由家鼠叮咬人時，將鼠疫桿菌注入人體皮下。再進入淋巴結內繁殖侵害，最常侵犯腹腹股溝淋巴結或腋窩淋巴結，引起淋巴結腫脹化膿及全身中毒，毒死率很高。

（2）敗血性鼠疫 繼發于腺鼠疫之后，這時機體抵抗力極度損害，細菌侵入血流，發生敗血癥，病死率極高。

（3）肺鼠疫或繼發性鼠疫 由吸入空氣中鼠疫桿菌直接引起，傳染性極強，在寒冷季節里很容易造成擴大流行，此型病癥最危險。繼發性肺鼠疫由腺鼠疫或敗血癥鼠疫患者體內細菌侵入自身肺內引起的并發性肺炎，由病人呼吸散播，病死率極高。