核內DNA多次復制產生的子染色體平行排列, 且體細胞內同源染色體配對, 緊密結合在一起, 從而阻止了染色體纖維進一步聚縮, 形成體積很大的由多條染色體組成的結構叫多線染色體。多線化的細胞處于永久間期, 體積也相應增大, 它存在于雙翅目昆蟲的幼蟲組織內, 如唾液腺、氣管等。

多線染色體來源于核內有絲分裂(endomitosis)。對幼蟲果蠅唾液腺細胞的染色體分析發現比其他類型的細胞中的染色體粗100倍。在幼蟲發育期間, 這些細胞停止了分裂, 但體積不斷增大, DNA繼續進行復制,以維持細胞的高分泌活性。復制的DNA鏈并不分開而是平行排列, 產生的巨大染色體中所含DNA鏈是正常染色體的1024倍。