馬鈴薯種薯在貯藏期間對溫度、濕度和空氣要求很嚴格，它既不耐寒又怕高溫。因此，薯塊貯藏是馬鈴薯種薯全部生產過程中的一個重要環節。現把該技術介紹如下。
　　
　　1.溫度：為塊莖貯藏質量的最重要條件。據種養專業戶的貯藏經驗，薯堆內的溫度與周圍空氣溫度之差約是薯堆高度的1.8倍。通常要求堆高不超過2米，一般以窖高的l/2高度最為合適。及時做好堆溫的調節是貯藏的關鍵。貯藏初期溫度保持在15~20℃，傷口愈合以后應使窖溫降至適宜溫度。整個貯藏期的溫度保持在2~3℃較為適宜。這段時期應加強空氣流通，防止薯堆過熱。而在立春前后，塊莖正處于深休眠狀態，呼吸弱、放出熱量少，所以該期應防止外面冷空氣進入窖內，避免塊莖受凍。開春以后氣溫迅速升高，應防止外界熱空氣進入，避免塊莖發芽，降低食用和種用價值。
　　
　　2. 濕度: 剛收獲的種薯濕度大，薯堆內水汽量高。初期，在溫度高、濕度大的情況下，需要加強空氣對流，以降低薯堆內溫濕度。但當進入嚴冬季節，窖溫逐漸下降，此時窖門氣眼應全部封閉。最好在薯堆上覆蓋一定厚度的草或其它秸稈，使其頂部的塊莖較溫暖，不致使其濕度過大而引起腐爛，而且覆蓋物還可接受窖頂融化的霜水。窖藏期間濕度以80％~90％為最合適。
　　
　　3. o2和co2的濃度：在塊莖貯藏初期，需氧多，放出的co2也多。因此應創造較好的通氣條件，才不會引起缺氧和co2的積累。但如果通氣不良，就會引起薯塊組織窒息而產生“黑心”；co2過多則會造成發芽率降低。