但目前使用的熱泵裝置主要為閉式（又稱箱式）結構，在應用過程中存在如下問題:1、干燥中后期，干燥速度慢，干燥時間長；2、間歇工作，干燥規模小；3、變溫運行較為困難。熱泵干燥具有良好的除濕與節能效果，如何在農副產品的干燥加工中發揮熱泵干燥的優勢，克服現存的問題，這需要采取一些綜合措施。
　　
　　措施一：高溫熱泵的開發
　　
　　研究和應用較多的熱泵干燥裝置是低溫熱泵干燥裝置，它使用的制冷劑主要為R22和R134a在干燥過程中，干燥溫度一般不大于65℃。開發提供干燥溫度達100℃以上的高溫熱泵是生產所必需的。
　　
　　二氧化碳（R744）作為天然的環保型制冷劑具有獨特的優點，一些歐洲國家、日本和美國等國對CO2熱泵熱水器系統進行了廣泛的研究，以CO2跨臨界循環的熱泵熱水器已出現在市場。采用傳統制冷劑的熱泵熱水器所提供的熱水溫度一般小于55℃，而采用CO2跨臨界循環的熱泵熱水器可以提供90℃的高溫熱水，同時其COP值基本可以達到甚至高于常規熱泵的COP值。因此，開發采用CO2跨臨界循環的熱泵干燥機在技術上已趨于成熟，并且能夠實現高溫干燥的要求。
　　
　　措施二：干燥工藝的研究
　　
　　合理的干燥工藝可以實現高效與節能。但大部分研究都是將干燥系統和物料內部傳熱傳質機理分開研究，缺少系統化研究。為了將熱泵干燥技術應用于農副產品的加工，必須研究不同農副產品與熱泵相適應的干燥工藝，這需研究干燥物料的質量指標以及質量指標隨溫度含水量和干燥時間等的變化關系，為物料的最佳熱泵干燥工藝的確定提供依據。
　　
　　措施三：專用熱泵的開發
　　
　　農副產品的種類較多，但不同的產品有其不同的特性，因此通過對干燥工藝的研究，可以針對某類或某種產品開發綜合技術經濟指標優勢明顯的專用熱泵產品。
　　
　　措施四：采用聯合干燥、提高干燥速度
　　
　　熱泵干燥在低溫干燥中有較強的優勢，因此可以將熱泵與其它干燥方法相結合。在物料的初始干燥中采用熱泵，充分發揮熱泵在低溫干燥中除濕快又節能的特點，而在物料的中后期干燥中選用其它的干燥方式，從而在物料的整個干燥過程中縮短了干燥時間，達到高效節能的目的。