相比大田作物，蔬菜尤其是設施蔬菜具有更高的經濟效益。因此，農民往往選擇土壤肥力和灌溉條件較好的農田種植蔬菜，這種土壤本身一般不存在中微量元素缺乏問題。但隨著作物栽培種類和產量水平等的變化，作物對中微量元素的需求量上升，加之蔬菜長年施用大量的有機肥和化肥，菜田土壤的一些中微量元素缺乏問題日漸嚴重。

　　由于施用有機肥對土壤鐵、錳、銅、鋅有明顯的補充作用，蔬菜上這些元素的缺乏并不常見，所應避免的是過量問題。另外，鉬的需求量很小，菜園土壤缺鉬的情況也較少。

　　一般情況下，蔬菜作物對鎂的需求比較少，但對果菜類蔬菜，特別是露地栽培，鎂肥往往顯得比較重要。硫酸鎂比其他形態速效，果實肥大期用作追肥比較適宜。顯著缺鎂的土壤，施鎂量可達每公頃20～30千克。在果菜類栽培中，如在栽培前先施入少量鎂肥則比較安全。

　　近年來，有些地方由于長期施用高濃度不含硫化肥，導致一些需硫較多的作物（如大豆、蔥、蒜等）生長不良。硫肥在蔬菜中具有積極效果的為十字花科結球類蔬菜，洋蔥和大蒜，綠豆以及馬鈴薯等。其中油菜和蔥屬作物對硫的需求量很高，施用硫肥可使油菜增產，油菜籽的含油量提高，蔥屬作物施用硫肥還能提高其風味。如在作物生長過程中發現缺硫，可以用硫酸銨等速效性硫肥作追肥或噴施。

　　蔬菜上最為常見的缺素現象是缺鈣和缺硼。

　　鈣素的問題一般表現在蔬菜品質上，如番茄、辣椒等果菜類蔬菜的臍腐病，白菜、生菜等十字花科蔬菜的干燒心，芹菜黑心病以及胡蘿卜表面的空穴。科學研究表明，解決蔬菜的缺鈣問題，可通過增加空氣流通，如人工展開葉片，調節溫濕度來提高蒸騰速率，最有效的方法是通過葉面噴施的方式補充鈣肥。可在開花時對花序上下充分噴施2～3遍，對于瓜果類蔬菜最好在盛果期直接向果實表面噴施。鈣肥最好選用糖醇螯合的鈣肥，如甘露糖醇鈣，這種鈣肥可徹底解決鈣在植株體內移動很慢的問題。

　　硼是當今世界農業生產上普遍缺乏而又應用最廣的微量元素之一。蔬菜缺硼的主要原因，一是大部分作物對硼的需求量較高，如油菜、芹菜、甜菜、菠菜、蘿卜等作物對硼高度敏感，另外一個原因是硼與硝酸鹽一樣易淋洗，而蔬菜栽培中尤其是設施栽培灌溉量過大，土壤可溶性硼很容易被淋失。

　　解決蔬菜缺硼可土施硼肥，在作物播種或移栽整地前，每公頃基施含硼量較高的顆粒狀五水硼酸鈉3千克。也可采用葉面噴肥的方式補充硼素，它的特點是有效、經濟、安全。由于硼在大部分蔬菜中的主要運輸途徑為木質部，則這類蔬菜應該在需硼量最高的時期噴施，最有效的噴施時期是：茄果類蔬菜在苗后期、初花期共噴2～3次；根莖類蔬菜在苗后期至塊根生長期噴兩次；甘藍類蔬菜在苗后期、蓮座期、結球初期共噴2～3次；葉菜類蔬菜在苗后期至生長旺期噴施2～3次。當田間發生缺硼癥狀時，應盡快噴施2或3次，每次間隔5～7天。葉噴推薦施用水溶性和含量均較高的八硼酸鈉鹽或八硼酸鉀鹽，噴施濃度為800～1000倍。作物苗期濃度可酌情降低，生長后期稍高，切忌超過施用濃度而造成硼中毒，導致葉片失綠變枯和花果脫落。