果蠅的P因子有兩種類型，一類是全長p因子，長2 907 bp，兩端有33bp的反向重復序列(IR)，有4個外顯子，編碼轉座酶。含戶因子的果蠅稱P品系。另一類是不能編碼轉座酶，依賴于全長戶因子才能轉座移動的缺失型戶因子。這類P因子都是活性戶因子的中段缺失型衍生物。長度從0．5 kb到1．4 kb不等。果蠅P品系的基因組有30—50份P因子拷貝，其中約三分之一是全長p因子。全長P因子的4個外顯子編碼轉座酶，但只在生殖系細胞中實現完整的RNA剪接，生成有活性的轉座酶，相對分子質量為87×103。在體細胞中，RNA剪接不完整，最后一個內含子未除去，因而只有前面3個外顯子編碼產生只有66×103的轉座酶，是沒有生物學活性的。這就是P因子在體細胞中轉座的抑制元件。
當把最后一個內含子精確地除去，使第3和第4個外顯子連接，如同在生殖細胞中發生正確RNA剪接，則這個經過處理的戶因子照樣可以在體細胞中轉錄。果蠅P因子轉座的后果是出現雜種發育障礙(hybrid dysgenesis)。當P品系雄果蠅(帶有全長和缺失的P因子)和M品系雌果蠅(不含P因子或只含缺失的P因子)交配時，可能由于雄果蠅DNA的進入而突然生成了轉座酶，結果使很多的P因子發生轉座，造成插入突變。這樣雜交生下的子代出現染色體畸變和生育力下降。可是，M品系雄果蠅和M品系雌果蠅雜交，或者P品系的雌雄果蠅雜交，都不會出現這種生育障礙。其原因是雌果蠅基因組中完整的全長P因子不能激活缺失型P因子的轉座。這表明細胞質對P因子的轉座也有重要作用，細胞質起這種作用的稱為細胞型(cytotype)。含P因子的P品系即為P細胞型，不含P因子的M品系為M細胞型。只有當含p因子的染色體出現在M細胞型中時，才會使雜種子代出現雜種發育障礙。目前認為，這是因為在P細胞型的卵細胞質中含有大量的相對分子質量為66×103的P因子轉座抑制元件，從而抑制了p因子的轉座。 p因子及其他能產生雜種發育障礙的轉座系統，因能有效地將相互雜交的群體逐漸地隔離開來，并在生殖細胞中引入新的突變，因而可能在物種形成中有重要作用。缺失型P因子可作為載體，在用外源基因填補其缺失的中間片段后，將這種重組DNA分子連同全長P因子一起注入M細胞型胚胎中。由此生成的果蠅的基因組的某些位置上將獲得轉入的外源基因。