1. B淋巴細胞缺陷疾病模型 臨床常表現為免疫球蛋白缺失， 細胞免疫正常。 如CBA/N小鼠，起源于CBA/H品系，為X-染色體隱性遺傳，其基因符號為xid。純和型雌鼠(xid/xid)和雜合型雄鼠(xid/y)對Ⅱ型抗原(非胸腺依賴性抗原)以及雙鏈DNA 等沒有反應。對胸腺依賴性抗原缺乏抗體反應，IgG3、IgM低下。如果移植正常鼠的骨髓到xid宿主，B細胞缺失可得到恢復。而將xid鼠的骨髓移植到受射線照射的同系正常宿主，其仍然表現為不正常的表型。
2. T淋巴細胞缺陷動物疾病模型 胸腺分泌淋巴細胞缺陷導致細胞免疫功能喪失，臨床表現為毛發缺乏和胸腺發育不全。1966年在蘇格蘭的一群小鼠中發現了一種突變種--自發無毛小鼠，該鼠生長不良，繁殖力低下，易發生嚴重感染，到1968年對無毛小鼠進行縱膈連續切片，顯示出胸腺缺失，遺傳檢查為常染色體隱性遺傳，這種動物能接受同種或異種組織移植。現在有多種遺傳性無胸腺動物，如裸小鼠、裸大鼠、裸豚鼠和遺傳性無脾癥小鼠動物模型。
3. T、B淋巴細胞聯合免疫缺陷動物疾病模型 這是最嚴重的免疫缺陷疾病,動物臨床表現為低γ球蛋白血癥、低淋巴細胞血癥，由于B淋巴細胞缺乏， 在淋巴結內生發中心消失，由于T淋巴細胞缺乏，在脾動脈周圍細胞鞘和淋巴結副皮質區縮小、淋巴細胞減少。SCID(severe combind immuno deficiency)小鼠由美國Bosma M.J于1980 年首次發現，1988年由Jackson實驗室引入我國。遺傳檢查為第16號染色體上隱性突變基因,為C、B17/Icrj同源近交系。