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Southern印跡雜交

放大字體  縮小字體 發布日期:2006-07-01


(一)濾膜的準備

提取基因組(染色體)DNA
用適當限制性內切酶(如BamHI、EcoRI、HindIII或Pst I)消化DNA,

重蒸水 11µl

基因組DNA 5µl(3-5µg)

10×緩沖液 2µl

限制性內切酶 2µl

總量為20µl

3. 37℃條件下保溫10-24小時。

4. 取2µl樣品在0.7-1%凝膠上在TBE溶液中進行電泳檢查。

5.確定后,樣品與DNA分子量標準一起膠電泳。

6.電泳結束后,在凝膠的側沿放一把直尺進行拍照,并做標號。

7.將電泳凝膠用蒸餾水沖洗后,放入100ml depurination solution中,室溫條件下緩慢振動浸泡15min。(膠顯黃色)

8.凝膠蒸餾水沖洗后,轉移到100ml 變性溶液中緩慢振動浸泡20分鐘,換新的變性溶液,再振動浸泡20分鐘。(膠顯藍色)

9.水洗凝膠后,轉移到中和溶液緩慢振動浸泡15,然后換溶液后,再浸泡15min。

10.毛細管作用,將DNA從瓊脂糖凝膠轉移到硝酸纖維素濾膜或尼龍膜上。


取出雜交尼龍膜,在其上面做上記號,在6×SSC溶液中非常緩慢轉動條件下清洗5min。(含有DNA面朝上)將其從溶液中取出,放在Whatman 3MM濾紙上,讓其自然風干。 夾在兩張濾紙中,放在80℃條件下烘烤2小時,使其完全固定。


(二)探針的標記

1、取10ng-30g DNA,,用雙蒸水定容至15μl.

2、在沸水浴中變性DNA 10 min,迅速放入冰浴中。

3、在變性DNA中添加下列試劑

六聚寡核苷酸 2μl

dNTP標記混合物 2μl

Klenow enzyme 1μl

總體積20μl

4、混勻、少許離心后,在37℃條件下培養。

5、添加2μl的0.2 EDTA(PH8.0),或者65℃加熱10分鐘終止反應。

(三)雜交:

1、預熱適當體積的DIG Easy Hyb (2ml/100cm2膜)

2、在合適的容器中,預雜交膜30min,柔和搖動,預雜交。

3、在沸水浴中5min,變性大約25mg/ml的DIG標記DNA探針,然后迅速在冰浴中冷卻。

4、倒去雜交液,添加探針和雜交液到膜,在緩慢振動情況下保溫雜交6h或者過夜。

5、用洗液Ⅰ(2*ssc,0.1℅SDS)在室溫條件下洗2次,每次15min。

6、用預熱的洗液Ⅱ(0.5*ssc,0.1℅SDS),在65-68℃的條件下,搖動洗2次,每次15min。

(四)免疫檢測:

1、 雜交后,洗液中漂洗膜1-5min

2、 在100ml終止液中(blocking solution),保溫30min。

3、 在200ml抗體溶液(Antibody solution)中保溫30min。

4、 用100ml洗液洗2次,每次15min。

5、 用20ml檢測液平衡2-5min。

6、 在黑暗中,加10ml colorsubstrate 溶液于適當容器中,保溫。在顯色的過程中不要搖動。(淡色的反應開始在幾秒鐘,在16小時后完全反應)

7、 膜曝光后短時間內檢測顯色

8、 用ddH2O或者TE buffer洗膜,終止反應。

 
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