相當一部分果農在給果樹施肥時，還存在著方法不科學和施肥部位不當的現象。大多數施肥部位離樹干較近，不僅降低了肥料的利用率，而且傷害了果樹大根，影響果樹的生根、開花結果，造成減產。

果樹對肥料的吸收主要靠根系中根毛來完成，在根毛區施肥，可以提高肥料的利用率，增產增收。一般情況下，水平根的分布范圍為果樹冠徑的1~1.5倍，但大部分集中于樹冠投影的外緣稍遠處，呈垂直分布，由于樹種、土質和管理水平不同而有差異。一般蘋果、桃、李等果樹的根系分布較淺，為40厘米左右；梨、葡萄等果樹的根系分布較深，為80厘米左右。施肥應施在樹冠投影處緣處或稍遠處。根系分布深的果樹要適當深施，反之淺施。

有機肥分解慢，但供肥期較長，可適當深施；化肥移動性大，可淺施。對于密植果園，可在行間深施，在株間淺施，最好不傷或少傷大根，這樣方能充分發揮肥效，提高肥料的利用率，達到增產增收的目的。