砂鍋燉菜固然有它獨特的風味，但常食砂鍋菜對人體健康是不利的。因為普通砂鍋是粘土為主，加入長石、石英經高溫燒制而成。用這種鍋燉菜，由于加熱時間過長，動物性食物原料蛋白質降解，水的化解能力減弱，凝膠液體大量析出，使其韌性增加，食用時口感差，不利于人體的消化吸收。用砂鍋燉菜的菜肴，維生素B1、B2平均損失率高達89%左右，維生素C損失率高達100%。另外，使用砂鍋燉制菜肴，由于密封較嚴，原料中異味物質也很難逸出，部分戊酸、戊醛及低脂肪酸，還存在于原料及湯汁中，在熱反應時，會生成對人體有害的物質。
       還有的砂鍋陶制品經涂釉料燒結，其中鉛、砷等有害物質因反復加熱解析，長石、石英等無機物也會脫溢，如長期食用，哪怕食量甚少，也會導致慢性中毒。故砂鍋燉菜不宜常吃。