又稱遺傳型。某一生物個體全部基因組合的總稱。在雜交試驗中，專指所研究的、與分離現象有關的基因組合，如純種高莖豌豆（DD）、雜種高莖豌豆（Dd）等。基因型一般不能直接看到，需要通過雜交（測交）試驗從表現型來推知。顯性不完全時，基因型與表現型一致，例如，表現型為透明金魚、普通金魚和五花魚的金魚，它們的基因型分別是TT、Tt、和tt；顯性完全時，基因型與表現型不一致，例如，純種高莖豌豆的基因型是DD，雜種高莖豌豆的基因型是Dd。在這種情況下，必須通過測交試驗，根據后代的表現，才能推知高莖豌豆的基因型是DD還是Dd。以高莖豌豆與純種矮莖豌豆雜交，如果測交后代都是高莖豌豆，便可推知它的親本的基因型是DD；反之如果測交后代中高莖和矮莖各占一半，那就證明它的親本的基因型是Dd。